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Jes Rust completó sus estudios en geología, paleontología y zoología en Gotinga y Kiel. Su tesis trató de la evolución de los caracoles fósiles que vivieron en las aguas dulces y salobres de la Grecia prehistórica. Su asistencia en el Instituto de Zoología de Gotinga entre 1993 y 1999 fue seguida de su nombramiento en 2001 de profesor de paleontología de los invertebrados y filogenia de los insectos en la Universidad de Bonn.